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《临床医学工程》为重要科技文献数据库来源期刊。
——中国学术期刊综合评价数据库（CAJCED）统计源期刊（编号：ZY0849），颁证单位：中国科学文献计量评价研究中心（中国科学院文献情报中心、中国社会科学院文献信息中心、中国学术期刊<光盘版>电子杂志社、北京大学图书馆）。
——中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊（编号GD084），颁证单位：中国科学技术信息研究所、万方数据股份有限公司。
——中文科技期刊数据库（全文版）收录期刊（编号06－1063），颁证单位：科学技术部西南信息中心、重庆维普资讯有限公司。
——Airiti Library(台湾华艺线上图书馆)全文收录期刊，颁证单位：台灣華藝數位股份有限公司。

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